注册个体户公司存在以下风险：首先，个体户公司没有法律人格，业务亏损或者欠债可能会影响到个体户所有人的个人财产;其次，注册个体户公司时需要承担相应的责任和义务，如缴纳税款、报税等，如果没有做好相应的工作，可能会面临经济处罚及法律制裁;再次，由于个体户公司缺乏规范管理，公司内部存在许多问题需要个人承担，一旦公司运营出现问题，个体户会承担全部责任。

因此，注册个体户公司具有一定的风险，需要谨慎考虑和妥善规划，以降低风险。

同时，个体户公司不同于有限责任公司，也需要明确自身的经营目标和方向，加强内部管理和规范化经营，才能提高公司运营的稳定性和长期发展性。