三门版的宝马MINIONE和三门版的宝马MINICOOPER在以下几个方面存在区别：

发动机功率：宝马MINIONE采用1.6L发动机，功率为98马力。

而宝马MINICOOPER采用1.6L发动机，功率为120马力。这意味着MINICOOPER的引擎更强大，驾驶时的加速更为迅速。

轮毂：宝马MINIONE的轮胎为6个高比率轮毂。而宝马MINICOOPER的轮胎高比较小，车身的轮毂为10个。

综上，三门版的宝马MINIONE和三门版的宝马MINICOOPER在发动机功率和轮毂设计上存在明显的区别。

MINICOOPER在发动机功率和轮毂数量上均优于MINIONE，提供了更为强劲的动力和独特的外观设计。

然而，具体的选择应根据个人的需求和喜好来决定。