如果补缴职工医保单丢失了，可以按照以下步骤处理：

1. 第一时间联系所在单位的人力资源部门或医保经办机构，说明情况并咨询补办流程。

2. 根据单位或医保经办机构的要求，可能需要提供相关证明材料，如身份证复印件、工资单等，以证明个人的相关信息。

3. 根据单位或医保经办机构提供的指引和要求，重新办理补办手续，并可能需要支付相应的罚款或滞纳金。

4. 完成补办手续后，保存好相关证明材料和证件。

需要注意的是，具体的补办流程和要求可能因地区和单位而异，建议及时咨询相关部门或机构的工作人员，以确保顺利办理。