用药治疗，采用浓度值0.01%浓度孔雀绿溶液，将身上有白点的金鱼浸泡多天，直至小白点完全消失，孔雀绿溶液是有毒的，所以使用时要注意严格地控制孔雀绿溶液的使用浓度以及量，不高浓度过量使用，否则金鱼亦会被毒死，或使用市面上可以买到的一些治疗金鱼白点病的药剂，然后按照说明使用也是可以的。

应用药物治疗金鱼白点病比较的麻烦，并且药物所使用的标准十分的严格，稍微不当的使用就会导致鱼体死亡，且治疗效果不佳。物理治理方法，简单又比较的有效，副作用小。使用加温器将水温非常缓慢的逐步加热到28摄氏度，并保持3天，以后逐渐恢复正常水温并调换新水，一周内白点原虫全部脱离。