通常根据当地政府的相关规定来确定，具体补偿标准可能包括：
1. 土地补偿费：根据土地的性质、面积和地段等因素确定合理的补偿标准；
2. 补偿款：根据苗木及设施的实际价值确定合理的补偿款；
3. 文化遗址补偿费：如果苗圃基地位于文化遗址区域，可能还需要支付相应的文化遗址保护费用；
4. 迁移费用：包括苗木搬迁、基地设施搬迁及重新建设等费用；
5. 生产损失补偿：如果因为征地搬迁导致苗圃基地的生产受到影响，可能还需进行合理的生产损失补偿；
6. 其他相关费用：根据实际情况可能还需要支付其他相关费用，如劳务费、设备维护费等。