据研究，巴西龟闭着眼睛的时候眼睛会变成红色，是因为它的眼睛表面有一层透明的血管膜。这个血管膜将眼球保护起来，保持眼球湿润。

当巴西龟关闭眼睛的时候，由于血管膜没有光敏细胞，所以不会感受到外界光线，眼睛也就不需要进行聚焦和感光的作用，而此时血管膜内血液色素的折射和反射给人以眼睛是红色的错觉。

所以，巴西龟闭着眼睛眼睛变红的原理就是因为血管膜的透明性导致的。